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全基因組測(cè)序
全基因組測(cè)序是對(duì)未知基因組序列的物種進(jìn)行個(gè)體的基因組測(cè)序。 1986年, Renato Dulbecco是最早提出人類基因組測(cè)序的科學(xué)家之一。他認(rèn)為如果能夠知道所有人類基因的序列,對(duì)癌癥的研究將會(huì)很有幫助。美國(guó)能源部(DOE)與美國(guó)國(guó)家衛(wèi)生研究院(NIH),分別在1986年與1987年加入人類基因組計(jì)劃。除了美國(guó)之外,日本在1981年就已經(jīng)開始研究相關(guān)問題,但是并沒有美國(guó)那樣積極。到了1988年,詹姆士·華生(DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn)者之一)成為NIH的基因組部門主管。1990年開始國(guó)際合作。1996年,多個(gè)國(guó)家召開百慕達(dá)會(huì)議,以2005年完成測(cè)序?yàn)槟繕?biāo),分配了各國(guó)負(fù)責(zé)的工作,并且宣布研究結(jié)果將會(huì)及時(shí)公布,并完全免費(fèi)。
轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)廣義上指某一生理?xiàng)l件下,細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的集合,包括信使RNA、核糖體RNA、轉(zhuǎn)運(yùn)RNA及非編碼RNA;狹義上指所有mRNA的集合。蛋白質(zhì)是行使細(xì)胞功能的主要承擔(dān)者,蛋白質(zhì)組是細(xì)胞功能和狀態(tài)的最直接描述,轉(zhuǎn)錄組成為研究基因表達(dá)的主要手段,轉(zhuǎn)錄組是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質(zhì)組的必然紐帶,轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控是目前研究最多的,也是生物體最重要的調(diào)控方式。
外顯子組測(cè)序
也稱目標(biāo)外顯子組捕獲,是指利用序列捕獲技術(shù)將全基因組外顯子區(qū)域DNA捕捉并富集后進(jìn)行高通量測(cè)序的基因組分析方法。是一種選擇基因組的編碼序列的高效策略,外顯子測(cè)序相對(duì)于基因組重測(cè)序成本較低,對(duì)研究已知基因的SNP、Indel等具有較大的優(yōu)勢(shì)。
外顯子(expressed region)是真核生物基因的一部分,它在剪接(Splicing)后仍會(huì)被保存下來,并可在蛋白質(zhì)生物合成過程中被表達(dá)為蛋白質(zhì)。外顯子是最后出現(xiàn)在成熟RNA中的基因序列,又稱表達(dá)序列。既存在于最初的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中,也存在于成熟的RNA分子中的核苷酸序列。在人類基因中大約有180,000外顯子,占人類基因組的1%,約30MB。
外顯子組測(cè)序是確定罕見的孟德爾遺傳疾病的因果變化高效策略。
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