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DARUI SERVICE
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Scientific research and service
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微生物研究
Microbiology research
達(dá)瑞病原微生物檢測(cè)平臺(tái)將基于多個(gè)平臺(tái)打造感染項(xiàng)目的全覆蓋檢測(cè)服務(wù)品牌,從快速培養(yǎng),到血清學(xué)檢測(cè)和核酸檢測(cè),從一代測(cè)序,二代測(cè)序到三代測(cè)序,從低通量的QPCR、核酸質(zhì)譜到高通量測(cè)序,多種組合供臨床選擇,為感染項(xiàng)目保駕護(hù)航,主要從以下幾個(gè)方面研發(fā):首先三代測(cè)序作為基因測(cè)序的POCT,打造床邊檢測(cè)服務(wù),廣譜檢測(cè)不遺漏微生物,結(jié)合二代測(cè)序基于宏基因組、宏轉(zhuǎn)錄組和單菌基因組流程,為疾病尋根問底提供更好的依據(jù);然后是核酸質(zhì)譜平臺(tái)微生物檢測(cè)流程改良,對(duì)于不同科室的小Panel可供臨床選擇,為多樣化服務(wù)提供更好的對(duì)接;以及快速培養(yǎng)為微生物單菌檢測(cè)提供更好的陽(yáng)性方案,培養(yǎng)作為金標(biāo)準(zhǔn),快速找到對(duì)應(yīng)的微生物,對(duì)于臨床判定增加更好的依據(jù)。
微生物研究
第二代測(cè)序技術(shù)
以Roche公司的454技術(shù)、Illumina公司的Solexa技術(shù)和ABI公司的Solid技術(shù)為標(biāo)志的第二代測(cè)序技術(shù)被稱為下一代測(cè)序技術(shù)(next generation sequencing,NGS)在極大降低了測(cè)序成本的同時(shí),還大幅提高了測(cè)序速度,并且保持了高準(zhǔn)確性,在病原微生物的快速檢測(cè)、溯源及傳染病性疾病防控等公共衛(wèi)生方面發(fā)揮越來越大的作用。
454技術(shù)的發(fā)明人之一Jonathan Rothberg還發(fā)明了一種基于半導(dǎo)體芯片的測(cè)序技術(shù)-Ion Torrent。該項(xiàng)技術(shù)僅在信號(hào)檢測(cè)方面與454技術(shù)有所不同,在測(cè)序過程中不是通過檢測(cè)焦磷酸熒光顯色,而是通過檢測(cè)H+信號(hào)的變化來獲得序列堿基信息。該技術(shù)使用了一種布滿小孔的高密度半導(dǎo)體芯片,可以檢測(cè)反應(yīng)池中的pH值的變化。當(dāng)離子感受器感受到H+信號(hào),H+信號(hào)再轉(zhuǎn)化為數(shù)字信號(hào),從而讀出DNA序列。Ion Torrent相比于其他測(cè)序技術(shù)來說,不需要昂貴的成像設(shè)備,因此,設(shè)備成本較低,測(cè)序速度快,整個(gè)上機(jī)測(cè)序可在2~3.5 h內(nèi)完成,ABI公司基于Ion torrent 平臺(tái)推出的Ion Proton與S5測(cè)序平臺(tái),通量15Gb的通量,運(yùn)行時(shí)間7h,對(duì)應(yīng)的病原微生物二代測(cè)序試劑盒和分析解讀軟件,實(shí)現(xiàn)了臨床檢測(cè)的高度自動(dòng)化和標(biāo)準(zhǔn)化。
第三代測(cè)序技術(shù)
以O(shè)xford Nanopore Technologies的納米孔單分子測(cè)序技術(shù)和PacBio公司的單分子實(shí)時(shí)測(cè)序技術(shù),被稱之為第三代測(cè)序技術(shù),其最大的特點(diǎn)是實(shí)現(xiàn)了對(duì)一個(gè)DNA分子的序列測(cè)定,也就是說在測(cè)序過程無需進(jìn)行PCR反應(yīng)來對(duì)模板分子進(jìn)行擴(kuò)增以擴(kuò)大檢測(cè)信號(hào)的強(qiáng)度,這就避免了PCR過程中所引入的偏差(Bias)和錯(cuò)誤(Error),實(shí)現(xiàn)了對(duì)特殊序列的DNA片段的測(cè)序。納米孔(nanopore)測(cè)序技術(shù)是近年來發(fā)展的最具應(yīng)用潛力的測(cè)序技術(shù),納米孔的直徑非常細(xì)小,僅允許單個(gè)核酸聚合物通過,因而可以在此基礎(chǔ)上使用多種方法來進(jìn)行高通量檢測(cè)。

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